MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanomassiliicoccus sp. Mx1-Issoire

Total Repeats: 34353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021353	ACA	2	6	585	590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	511058889
2	NC_021353	TGA	2	6	676	681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058889
3	NC_021353	AGAT	2	8	702	709	50 %	25 %	25 %	0 %	511058889
4	NC_021353	GAG	2	6	741	746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	511058889
5	NC_021353	ATC	2	6	923	928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511058889
6	NC_021353	CTGG	2	8	957	964	0 %	25 %	50 %	25 %	511058889
7	NC_021353	ACA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	511058889
8	NC_021353	AG	3	6	992	997	50 %	0 %	50 %	0 %	511058889
9	NC_021353	ATC	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511058889
10	NC_021353	GAT	2	6	1070	1075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058889
11	NC_021353	ATG	2	6	1101	1106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058889
12	NC_021353	GCA	2	6	1185	1190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511058889
13	NC_021353	CCG	2	6	1304	1309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	511058889
14	NC_021353	AGAA	2	8	1390	1397	75 %	0 %	25 %	0 %	511058889
15	NC_021353	GAC	2	6	1403	1408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511058889
16	NC_021353	TGA	2	6	1509	1514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058889
17	NC_021353	ATA	2	6	1517	1522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	511058889
18	NC_021353	GAA	2	6	1529	1534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058889
19	NC_021353	TC	3	6	1587	1592	0 %	50 %	0 %	50 %	511058889
20	NC_021353	ATG	2	6	1655	1660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058889
21	NC_021353	GGC	2	6	1697	1702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	511058889
22	NC_021353	A	7	7	1745	1751	100 %	0 %	0 %	0 %	511058889
23	NC_021353	GAA	2	6	1757	1762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058889
24	NC_021353	TTC	2	6	1770	1775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511058889
25	NC_021353	A	6	6	1798	1803	100 %	0 %	0 %	0 %	511058889
26	NC_021353	AAC	2	6	1807	1812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	511058889
27	NC_021353	CTTTTT	2	12	1825	1836	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	511058890
28	NC_021353	CTG	2	6	1928	1933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511058890
29	NC_021353	TTC	2	6	2011	2016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511058890
30	NC_021353	T	6	6	2117	2122	0 %	100 %	0 %	0 %	511058890
31	NC_021353	ATTT	2	8	2125	2132	25 %	75 %	0 %	0 %	511058890
32	NC_021353	T	6	6	2162	2167	0 %	100 %	0 %	0 %	511058890
33	NC_021353	GCC	2	6	2203	2208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	511058890
34	NC_021353	TCA	2	6	2273	2278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511058890
35	NC_021353	TAT	2	6	2305	2310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	511058890
36	NC_021353	TGT	2	6	2398	2403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	511058890
37	NC_021353	TGC	2	6	2483	2488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511058890
38	NC_021353	ACT	2	6	2507	2512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511058890
39	NC_021353	GGC	2	6	2516	2521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	511058890
40	NC_021353	TAA	2	6	2562	2567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	511058890
41	NC_021353	TTA	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	511058890
42	NC_021353	ATG	2	6	2745	2750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058891
43	NC_021353	CCA	2	6	2781	2786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	511058891
44	NC_021353	A	6	6	2832	2837	100 %	0 %	0 %	0 %	511058891
45	NC_021353	TAC	2	6	2845	2850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511058891
46	NC_021353	GTTAG	2	10	2903	2912	20 %	40 %	40 %	0 %	511058891
47	NC_021353	GGC	2	6	2986	2991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	511058891
48	NC_021353	TG	3	6	3044	3049	0 %	50 %	50 %	0 %	511058891
49	NC_021353	AAG	2	6	3084	3089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058891
50	NC_021353	GAT	2	6	3101	3106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058891
51	NC_021353	GAG	2	6	3157	3162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	511058891
52	NC_021353	AGAA	2	8	3475	3482	75 %	0 %	25 %	0 %	511058892
53	NC_021353	CTT	2	6	3483	3488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511058892
54	NC_021353	CAG	2	6	3522	3527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511058892
55	NC_021353	AAG	2	6	3598	3603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058892
56	NC_021353	ACG	2	6	3622	3627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511058892
57	NC_021353	GCA	3	9	3630	3638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511058892
58	NC_021353	AGCTGT	2	12	3644	3655	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	511058892
59	NC_021353	AGA	2	6	3658	3663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058892
60	NC_021353	ATG	2	6	3678	3683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058892
61	NC_021353	CAA	2	6	3690	3695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	511058892
62	NC_021353	TGC	2	6	3713	3718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511058892
63	NC_021353	TCT	2	6	3783	3788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511058893
64	NC_021353	AGGA	2	8	3836	3843	50 %	0 %	50 %	0 %	511058893
65	NC_021353	GC	3	6	3936	3941	0 %	0 %	50 %	50 %	511058893
66	NC_021353	CAA	2	6	3989	3994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	511058893
67	NC_021353	TCG	2	6	4025	4030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511058893
68	NC_021353	CAGAC	2	10	4048	4057	40 %	0 %	20 %	40 %	511058893
69	NC_021353	TTG	2	6	4084	4089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	511058893
70	NC_021353	A	6	6	4099	4104	100 %	0 %	0 %	0 %	511058893
71	NC_021353	TCA	2	6	4138	4143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511058893
72	NC_021353	GAAT	2	8	4206	4213	50 %	25 %	25 %	0 %	511058893
73	NC_021353	AGA	2	6	4272	4277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058893
74	NC_021353	AGA	2	6	4398	4403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058893
75	NC_021353	TGA	2	6	4461	4466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058893
76	NC_021353	TCG	3	9	4478	4486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511058893
77	NC_021353	TAT	2	6	4622	4627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	511058893
78	NC_021353	AGA	2	6	4644	4649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058893
79	NC_021353	ATG	2	6	4670	4675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058893
80	NC_021353	AGTAGA	2	12	4686	4697	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	511058893
81	NC_021353	GAA	2	6	4699	4704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058893
82	NC_021353	TTC	2	6	4750	4755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511058893
83	NC_021353	CTC	2	6	4772	4777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	511058893
84	NC_021353	TCT	2	6	4884	4889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511058893
85	NC_021353	AAG	2	6	4896	4901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058893
86	NC_021353	GAA	2	6	4912	4917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058893
87	NC_021353	TGC	2	6	5013	5018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511058893
88	NC_021353	GGTA	2	8	5160	5167	25 %	25 %	50 %	0 %	511058893
89	NC_021353	TTA	2	6	5179	5184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	511058893
90	NC_021353	TAA	2	6	5189	5194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	511058893
91	NC_021353	ACA	2	6	5204	5209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	511058893
92	NC_021353	AGC	2	6	5232	5237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511058893
93	NC_021353	TTG	2	6	5300	5305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	511058893
94	NC_021353	ATC	2	6	5425	5430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511058893
95	NC_021353	AAT	2	6	5619	5624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	511058893
96	NC_021353	AAT	2	6	5715	5720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	511058893
97	NC_021353	AC	3	6	5727	5732	50 %	0 %	0 %	50 %	511058893
98	NC_021353	GGA	2	6	5742	5747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	511058893
99	NC_021353	AG	3	6	5975	5980	50 %	0 %	50 %	0 %	511058894
100	NC_021353	CGA	2	6	6010	6015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511058895
101	NC_021353	AAG	2	6	6036	6041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058895
102	NC_021353	CAA	2	6	6214	6219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	511058895
103	NC_021353	GGC	2	6	6293	6298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	511058895
104	NC_021353	AAG	2	6	6305	6310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058895
105	NC_021353	TCG	2	6	6312	6317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511058895
106	NC_021353	GA	3	6	6366	6371	50 %	0 %	50 %	0 %	511058895
107	NC_021353	GAAA	2	8	6517	6524	75 %	0 %	25 %	0 %	511058895
108	NC_021353	TTACGC	2	12	6597	6608	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	511058896
109	NC_021353	A	7	7	6628	6634	100 %	0 %	0 %	0 %	511058896
110	NC_021353	CCT	2	6	6636	6641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	511058896
111	NC_021353	ATG	2	6	6673	6678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058896
112	NC_021353	GAAA	2	8	6840	6847	75 %	0 %	25 %	0 %	511058896
113	NC_021353	AGA	2	6	6927	6932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058896
114	NC_021353	GAA	2	6	6970	6975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058896
115	NC_021353	TGCT	2	8	6989	6996	0 %	50 %	25 %	25 %	511058896
116	NC_021353	AGA	2	6	7104	7109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058896
117	NC_021353	TTA	2	6	7125	7130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	511058896
118	NC_021353	ATT	2	6	7137	7142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	511058896
119	NC_021353	TTTC	2	8	7180	7187	0 %	75 %	0 %	25 %	511058896
120	NC_021353	GGC	2	6	7288	7293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	511058896
121	NC_021353	CT	3	6	7303	7308	0 %	50 %	0 %	50 %	511058896
122	NC_021353	TGA	2	6	7359	7364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058896
123	NC_021353	ATG	2	6	7385	7390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058896
124	NC_021353	AG	3	6	7407	7412	50 %	0 %	50 %	0 %	511058896
125	NC_021353	AGG	2	6	7472	7477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	511058896
126	NC_021353	AG	3	6	7479	7484	50 %	0 %	50 %	0 %	511058896
127	NC_021353	AGAA	2	8	7537	7544	75 %	0 %	25 %	0 %	511058896
128	NC_021353	ATT	2	6	7567	7572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	511058896
129	NC_021353	A	6	6	7612	7617	100 %	0 %	0 %	0 %	511058896
130	NC_021353	CTG	2	6	7618	7623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511058896
131	NC_021353	CG	3	6	7795	7800	0 %	0 %	50 %	50 %	511058897
132	NC_021353	GTA	2	6	7848	7853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058897
133	NC_021353	GA	4	8	7880	7887	50 %	0 %	50 %	0 %	511058897
134	NC_021353	GGCTAA	2	12	7941	7952	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	511058898
135	NC_021353	GA	3	6	7958	7963	50 %	0 %	50 %	0 %	511058898
136	NC_021353	ATG	2	6	8018	8023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058898
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139	NC_021353	TTG	2	6	8179	8184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	511058898
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141	NC_021353	ATG	2	6	8195	8200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058898
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143	NC_021353	GTC	2	6	8326	8331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511058898
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148	NC_021353	TGC	2	6	8486	8491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511058898
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150	NC_021353	AG	3	6	8564	8569	50 %	0 %	50 %	0 %	511058898
151	NC_021353	GAG	2	6	8600	8605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	511058898
152	NC_021353	CAG	3	9	8650	8658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511058898
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154	NC_021353	GA	3	6	8940	8945	50 %	0 %	50 %	0 %	511058898
155	NC_021353	AGA	2	6	8961	8966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058898
156	NC_021353	GAA	2	6	8977	8982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058898
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158	NC_021353	ATCTGT	2	12	9066	9077	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	511058898
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162	NC_021353	AGA	2	6	9369	9374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058898
163	NC_021353	AGA	2	6	9377	9382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058898
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247	NC_021353	CA	3	6	12909	12914	50 %	0 %	0 %	50 %	511058901
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250	NC_021353	TCT	2	6	12975	12980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511058901
251	NC_021353	A	6	6	13095	13100	100 %	0 %	0 %	0 %	511058901
252	NC_021353	TATT	2	8	13101	13108	25 %	75 %	0 %	0 %	511058901
253	NC_021353	A	6	6	13113	13118	100 %	0 %	0 %	0 %	511058901
254	NC_021353	TCTGC	2	10	13123	13132	0 %	40 %	20 %	40 %	511058901
255	NC_021353	A	6	6	13349	13354	100 %	0 %	0 %	0 %	511058902
256	NC_021353	AG	3	6	13408	13413	50 %	0 %	50 %	0 %	511058902
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258	NC_021353	ATT	2	6	13483	13488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	511058902
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262	NC_021353	ATT	2	6	13649	13654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	511058902
263	NC_021353	AAT	2	6	13764	13769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	511058902
264	NC_021353	GAA	2	6	13916	13921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058902
265	NC_021353	GAC	2	6	13947	13952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511058902
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267	NC_021353	ATG	2	6	14042	14047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058903
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269	NC_021353	CTC	2	6	14094	14099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	511058903
270	NC_021353	CTT	2	6	14168	14173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511058903
271	NC_021353	TTG	2	6	14247	14252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	511058903
272	NC_021353	AC	3	6	14364	14369	50 %	0 %	0 %	50 %	511058903
273	NC_021353	CAG	2	6	14418	14423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511058903
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285	NC_021353	GAA	2	6	14945	14950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058903
286	NC_021353	GGA	2	6	14972	14977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	511058903
287	NC_021353	TGA	2	6	15060	15065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058904
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290	NC_021353	GCT	2	6	15202	15207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511058904
291	NC_021353	CGC	2	6	15210	15215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	511058904
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293	NC_021353	CTG	2	6	15227	15232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511058904
294	NC_021353	CAG	2	6	15245	15250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511058904
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297	NC_021353	AAG	3	9	15263	15271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058904
298	NC_021353	GCT	2	6	15286	15291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511058904
299	NC_021353	GCT	2	6	15301	15306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511058904
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303	NC_021353	TCT	2	6	15571	15576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511058905
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310	NC_021353	TGC	2	6	15899	15904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511058905
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351	NC_021353	AT	3	6	17960	17965	50 %	50 %	0 %	0 %	511058906
352	NC_021353	CAG	2	6	17986	17991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511058906
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362	NC_021353	TGCT	2	8	18590	18597	0 %	50 %	25 %	25 %	511058906
363	NC_021353	T	6	6	18640	18645	0 %	100 %	0 %	0 %	511058906
364	NC_021353	AATC	2	8	18702	18709	50 %	25 %	0 %	25 %	511058906
365	NC_021353	CGA	2	6	18726	18731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511058906
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368	NC_021353	TTA	2	6	18855	18860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	511058906
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372	NC_021353	CTTT	2	8	18963	18970	0 %	75 %	0 %	25 %	511058906
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375	NC_021353	CTAAT	2	10	19068	19077	40 %	40 %	0 %	20 %	511058906
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377	NC_021353	TAACAG	2	12	19309	19320	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	511058907
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379	NC_021353	GAC	2	6	19450	19455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511058908
380	NC_021353	T	6	6	19461	19466	0 %	100 %	0 %	0 %	511058908
381	NC_021353	TCT	2	6	19524	19529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	511058908
382	NC_021353	GAAA	2	8	19815	19822	75 %	0 %	25 %	0 %	511058909
383	NC_021353	TAC	2	6	19833	19838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	511058909
384	NC_021353	AAG	2	6	19848	19853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	511058909
385	NC_021353	GCT	2	6	19947	19952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	511058909
386	NC_021353	AG	4	8	19979	19986	50 %	0 %	50 %	0 %	511058909
387	NC_021353	GGC	2	6	20109	20114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	511058909
388	NC_021353	ATG	2	6	20274	20279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058909
389	NC_021353	ATG	2	6	20293	20298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058909
390	NC_021353	CAG	2	6	20351	20356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	511058909
391	NC_021353	TA	3	6	20367	20372	50 %	50 %	0 %	0 %	511058909
392	NC_021353	ATTC	2	8	20384	20391	25 %	50 %	0 %	25 %	511058909
393	NC_021353	GGA	2	6	20411	20416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	511058909
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497	NC_021353	T	6	6	27081	27086	0 %	100 %	0 %	0 %	511058913
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500	NC_021353	GAT	2	6	27150	27155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	511058913

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